Agarose vs Poliacrilamida
Existem várias diferenças em relação à agarose e poliacrilamida, incluindo sua estrutura física, toxicidade e seus métodos de derramamento, bem como seu preço. É útil conhecer essas diferenças, bem como suas semelhanças, se você estiver lidando com qualquer um desses tipos de géis.
Uma das principais diferenças entre esses dois géis é que a agarose é derramada horizontalmente, enquanto a poliacrilamida é derramada verticalmente. É muito mais fácil derramar agarose dessa maneira horizontal. A agarose pode ser aquecida para auxiliar no processo de vazamento, embora não deva ser aquecida a um grau tão extenso que a agarose acabe derretendo. Pode-se também decidir se usar pistas estreitas ou largas para despejar a agarose. Pode ser derramado usando este método de ranhura, e esta é uma de suas vantagens. Ao despejar, deve-se ter muito cuidado, pois a agarose é muito delicada e pode quebrar facilmente.
Por outro lado, como mencionado, a poliacrilamida é vertida verticalmente. A poliacrilamida necessita de placas de vidro para auxiliar nesse processo, pois sua estrutura é muito delgada, sendo necessário esse suporte adicional. Ao contrário da agarose, a poliacrilamida não pode ser reaquecida e depois derramada.
A agarose consiste em muitas moléculas, enquanto a poliacrilamida geralmente consiste em apenas uma molécula grande. As moléculas de agarose são mantidas juntas por forças intermoleculares, e as moléculas são feitas de DNA. Existem moléculas grandes e pequenas e, geralmente, as moléculas maiores são mais facilmente separadas do que as menores. A molécula de poliacrilamida é composta por GOTA ou proteína. As lacunas entre os géis de poliacrilamida são menores do que entre os géis de agarose, outra diferença entre essas duas substâncias. Onde o tamanho das bandas é o mesmo na agarose, existem vários tamanhos de bandas na poliacrilamida. Se a molécula de poliacrilamida for exposta ao ar, ela não se solidificará de maneira uniforme, pois o ar fixa o processo de polimerização.
Quanto à toxicidade, a agarose é considerada uma substância atóxica. Embora a poliacrilamida seja considerada o mesmo, seu pó é considerado tóxico, e é aconselhável até mesmo manusear os géis com medidas de proteção.
A poliacrilamida é usada para géis de sequenciação e géis de proteína. Suas vantagens são que ele tem propriedades de fácil coloração e pode ser seco para formar um gel. É comprado pré-derramado e é mais barato que a agarose, por cerca de US $ 5 '“7 por gel. (A agarose custa cerca de US $ 1 por grama). Recomenda-se que uma pessoa tenha experiência antes de comprar qualquer um desses dois géis, frequentemente, o número de amostras necessárias e a concentração do gel necessária devem ser conhecidos antes de qualquer compra.
Resumo:
1.Agarose é vertida horizontalmente, enquanto a poliacrilamida é vertida verticalmente.
2.Agarose é mais cara do que a poliacrilamida.
3.Agarose consiste em muitas moléculas, enquanto a poliacrilamida consiste em apenas uma molécula grande.
4. Ao contrário da poliacrilamida, a agarose pode ser reaquecida.
5.Agarose é considerada uma substância atóxica em todas as suas formas, enquanto o pó de poliacrilamida é considerado tóxico.